¿Como saber si un archivo está infectado?

Muchas veces nos encontramos con que tenemos en la computadora un archivo dudoso y no sabemos si es realmente un virus o no. Muchas veces si la computadora está infectada el virus logra evadir a los antivirus. En estos caso se puede usar antivirus via web. Una opción recomendable es virustotal al cual se puede subir un archivo para que sea analizado por múltiples antivirus.

Actualización:
Carlos, en los comentarios, agrega otros servicios online:
Similar a virustotal: jotti.org ,
Para escanear los discos:
Trend Micro
http://bit.ly/yYNw5">Panda